三、技術優勢：
1、高通量，低成本：一次測序可得到數百萬條序列，單次運行可經濟分析多個樣品；
2、高分辨率：基于高通量測序技術能夠直接從單核苷酸水平研究小分子RNA，不存在傳統芯片雜交的熒光模擬信號帶來的交叉和背景噪音問題，非常有利于區分相同家族以及序列極為相似的不同sRNA；
3、高精準度：reads能覆蓋sRNA全序列，可成功檢測低豐度表達的miRNA；
4、通用平臺，不依賴已知信息：可進行任何物種的sRNA序列測定，既能鑒定已知的miRNA，又能預測新的miRNA；
5、可重復性高：深度測序保證了抽樣隨機性，重復性非常好，無需重復實驗
四、樣本要求：
1、樣品類型：完整且無污染的總RNA；
2、樣品需求量（單次）：≥10 μg；
3、樣品濃度：≥200 ng/μL；
4、樣品純度：OD260/280 =1.8~2.2；OD260/230≥2.0；28S:18S≥1.5；RIN≥8.0；23S:16S≥1.5 （此項要求只針對原核生物）。
五、成功案例：
【案例一】：采用新一代測序技術分析浸水24小時后的玉米種子的小RNA文庫，進一步分析確認了115個已知miRNA屬于24個miRNA家族，并發現了167個新的玉米miRNA。使用同樣的方法，再次建立小RNA文庫，將獲得的已知miRNA和新發現miRNA的信息與重新構建的小RNA文庫進行比對，成功推測出106個新miRNA的候選靶標。研究結果顯示：玉米浸水種子中存在著miRNA媒介的基因表達調控。
